Navegando por Assunto "Sequenciamento de nucleotídeo"

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Relatório final de atividades do Estágio Supervisionado Obrigatório: estudo da diversidade begomoviral em leguminosas oriundas da região Norte e Nordeste do Brasil
(2025) Brito, Carlos Henrique Machado Dias de; Blawid, Rosana; http://lattes.cnpq.br/5904522485457534; http://lattes.cnpq.br/9026624159138479
O feijão (Phaseolus sp.) é uma cultura de grande importância socioeconômica em todo o Brasil e é cultivada tanto por grandes como pequenos agricultores. A cultura tem sido amplamente estudada no intuito de obter variedades geneticamente melhoradas para caracteres de produtividade e resistência ou tolerância a doenças. Dentre as principais doenças que acometem a cultura do feijão no Brasil estão as causadas por vírus. Os vírus relatados infectando a cultura do feijão no Brasil correspondem aos gêneros Begomovirus, Potyvirus, Comovirus, Carlavirus e Sobemovirus. Dentre os vírus pertencentes aos gêneros estudados, os begomovírus são considerados os mais importantes, pois podem causar perdas de até 100% da produção na cultura do feijão. Além disso, os begomovírus infectam uma ampla gama de hospedeiros, incluindo as plantas forrageiras e daninhas, que podem servir como fonte de inóculo viral. Este projeto teve como objetivo o estudo da diversidade de begomovírus em leguminosas de importância socioeconômica, especialmente nas culturas de feijão comum (Phaseolus vulgaris), caupi (Vigna unguiculata) e feijão-fava (Phaseolus lunatus), encontradas nas regiões Norte e Nordeste brasileiro. Portanto, este projeto visou contribuir com a agricultura brasileira da região Nordeste e Norte através da diagnose, estudos moleculares e epidemiológicos de begomoviroses na cultura do feijão. Para tanto, duas instituições nacionais (UFRPE, UFPE) e uma instituição internacional (DSMZ, Coleção Alemã de Microorganismos e Culturas de Células, Alemanha) trabalharam em conjunto no estudo da diversidade begomoviral em leguminosas de importância socioeconômica visando no futuro estabelecer medidas eficazes de manejo e controle de doenças virais.
Sequenciamento genético de nova geração e sua aplicabilidade na virologia veterinária: revisão de literatura
(2025-07-25) Guaraná, Ayrton Carlos Luz; Pinheiro Júnior, José Wilton; http://lattes.cnpq.br/3931532041328673; http://lattes.cnpq.br/1933294583713129
Objetiva-se com o presente relatório demonstrar as principais atividades exercidas pelo discente Ayrton Carlos Luz Guaraná sob orientação e supervisão, do Professor Dr. José Wilton Pinheiro Junior, da Universidade Federal Rural de Pernambuco e da Professora Dra. Líria Hiromi Okuda do Instituto Biológico, respectivamente. Este trabalho foi dividido em dois capítulos, no primeiro inclui-se uma descrição das atividades realizadas durante o período de vivência do estágio, e o segundo capítulo contém a revisão de literatura sobre Sequenciamento Genético de Nova Geração (NGS) e sua aplicabilidade na virologia veterinária. O Estágio Supervisionado Obrigatório (ESO) ocorreu no período de 14 de abril a 04 de julho de 2025, no Laboratório de Viroses de Bovídeos (LVB), que faz parte do Instituto Biológico (IB), também conhecido como Secretaria da Agricultura e Abastecimento, localizado no município de São Paulo, no bairro da Vila Mariana (Zona Sul). A revisão evidenciou que o NGS supera métodos tradicionais na detecção de vírus emergentes e coinfecções, com aplicações críticas em vigilância genômica (ex.: identificação de novas variantes de Felipivirus e Calicivirus felino). Plataformas como Illumina, Ion Torrent e Oxford Nanopore são eficazes na caracterização de variantes virais e suporte a estratégias profiláticas. Conclui-se que o NGS é indispensável para respostas rápidas a ameaças virais, embora desafios técnicos e econômicos persistam.
Uso dos sistemas CRISPR no diagnóstico do câncer
(2024-10-03) Coura Filho, Fábio de Souza Esteves; Souza, Paulo Roberto Eleutério de; http://lattes.cnpq.br/1971832245117283; http://lattes.cnpq.br/9573756167234737
Desde sua descoberta, o sistema CRISPR/Cas9 tem sido utilizado para identificar oncogenes e outros mediadores do câncer. Nesse sentido, tal ferramenta tornou-se relevante para pesquisas oncológicas. O objetivo do presente estudo foi realizar uma revisão da literatura para avaliar e mapear a eficiência do sistema CRISPR-Cas (SHERLOCK e DETECTR) no diagnóstico do câncer considerando a precisão diagnóstica, progressão da doença, taxa de sobrevida, necessidade de tratamentos agressivos e custos de saúde ao longo do tempo. A revisão contou com pesquisas feitas nas bases de dados: National Library of Medicine (PubMed), Science Magazine, Science Direct e Nature. Os descritores utilizados na pesquisa foram: Diagnostic, CRISPR-Cas, Cancer, Neoplasm, Diagnosis, Diagnostic test, SHERLOCK, DETECTR, Crispr, Detection, Reporter, Cas12, Cas13, Cas12a, Cas13a, C2c2 e Cpf1. Utilizou-se como critérios de inclusão artigos publicados nos últimos 8 anos (2017 a 2024) que se apresentem em portugues ou inglês. Como critérios de exclusão foram eliminados por título, ou resumo, os estudos que não possuíam coerência com o tema, artigos fora do intervalo temporal, ou que estivessem duplicados. A pesquisa inicial identificou 2057 artigos em diversas bases de dados. Após a exclusão manual dos artigos duplicados e triagem de resumos, 90 artigos passaram para a leitura integral, o que resultou em 15 artigos selecionados para extração de dados. O principal objetivo desses estudos selecionados foi explorar a eficácia e precisão das ferramentas CRISPR para detectar mutações genéticas e biomarcadores associados ao câncer, com ênfase em diagnósticos menos invasivos e personalização de tratamentos. As amostras incluíram DNA genômico de pacientes com câncer, focando na detecção de mutações associadas a diferentes tipos de câncer, como câncer de ovário e mama. Os dados coletados indicaram que, além de melhorar a precisão diagnóstica, esses métodos têm o potencial de impactar positivamente a progressão da doença e a taxa de sobrevida, reduzindo também a necessidade de tratamentos agressivos e, desta forma, poderão transformar a abordagem atual ao diagnóstico e tratamento do câncer.