Bacharelado em Agronomia (Sede)
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Resultados da Pesquisa
Item Diversidade de espécies de Colletorichum associadas à antracnose do Inhame no estado de Pernambuco(2024) Silva, Myrella Graziela Gomes da; Câmara, Marcos Paz Saraiva; http://lattes.cnpq.br/3368616411048863; http://lattes.cnpq.br/4009798926901196O inhame é uma monocotiledônea perene, pertencente ao gênero Dioscorea e familìa Dioscoreaceae. A antracnose do inhame ocasionada por espécies de Colletotrichum, causam manchas necróticas que tendem a coalescer formando grandes áreas necrosadas. O objetivo deste estudo foi avaliar a diversidade de espécies de Colletotrichum associadas à antracnose do inhame no estado de Pernambuco. As coletas foram realizadas em três municípios do estado de Pernambuco: Bonito, Recife e Vitória de Santo Antão. Folhas com sintomas característicos de antracnose foram encaminhadas ao Laboratório de Micologia da Universidade Federal Rural de Pernambuco. Os isolados foram obtidos de fragmentos de folhas de inhame. Os fragmentos foram desinfestados em etanol 70% por 30 segundos, seguido por hipoclorito de sódio à 1,5% por 1 minuto, e lavagem dupla em água destilada esterilizada por 30 segundos. Os isolados obtidos foram preservados pelos métodos de Castellani e sílica-gel. As preservações foram depositadas na coleção do Laboratório de Micologia. Posteriormente iniciou-se a identificação molecular dos isolados. Para obtenção do DNA genômico, os isolados foram cultivados em placas de Petri com meio de cultura asparagina e incubados por 7 dias. Os resultados das extrações foram visualizados em gel de agarose a 1,5%. Para identificação molecular, foram sequenciados genes informativos para esse gênero fúngico. As relações evolutivas foram analisadas utilizando a análise de máxima verossimilhança (MV). Para o teste de patogenicidade, mudas de inhame (cv. da Costa) com 45 dias de idade, foram inoculadas com suspensão de esporos (106 conídios mL-1) mediante ferimento, com isolados representativos de cada espécie de Colletotrichum. As mudas inoculadas foram mantidas em câmara úmida por 24h e a avaliação se deu 7 dias após a inoculação. A avaliação consistiu na medição do diâmetro ortogonal das lesões. A testemunha foi inoculada com água destilada esterilizada. Foram obtidos 39 isolados de Colletotrichum a partir das lesões de antracnose no inhame. Através da identificação molecular constatou-se 6 espécies de Colletotrichum ocasionando a doença. Todos os isolados avaliados foram patogênicos. A espécie Colletotrichum sp1 foi a prevalente entre os municípios pernambucanos e também a mais virulenta.Item Leveduras presentes na microbiota de batata doce e seu pontecial de aplicação no biocontrole do agente casual do mal-do-pé da batata doce(2024) Silva, Elder Felipe de Moura; Laranjeira, Delson; http://lattes.cnpq.br/1262204427401043; http://lattes.cnpq.br/8551632344697704A batata doce (Ipomoea batatas L.) é uma hortaliça que pertence à família Convolvulaceae, é umas das principais raízes consumidas no mundo. Por ser uma cultura considerada rudimentar é cultiva com poucos recursos tecnológicos, cultivado principalmente por pequenos produtores, para subsistência e autoconsumo. Considerando dados mundiais do cultivo da batata-doce, o país com maior produção é a China onde representam nos últimos quatro anos uma média de 82,30% da produção mundial, em segundo lugar vem a Nigéria com 1,92%, a produção brasileira representa 0,30 % do total produzido (FAOSTAT,2016). A doença do mal-do-pé da batata doce gera um prejuízo de quase 80% nas áreas mais afetadas(ALMEIDA, 2018). Na região Nordeste, onde esse estudo tem sido realizado, a produtividade média é de 11 ton. ha-1, enquanto a produtividade média da cultura no país é de cerca de 14 ton.ha-1 da produção brasileira (IBGE,2019).Os isolados fitopatogênicos de Diaporthes spp. foram obtidos em diferentes estados, no Nordeste brasileiro, sendo eles Pernambuco, Alagoas e Sergipe. Para os ensaios de prospecção de controle biológico, os isolados fitopatogênicos estãosendo submetidos ao cultivo conjunto, in vitro, com leveduras isoladas da batata-doce. Dados sobre o controle desta doença usando organismos biocontroladores são escassos, nesse âmbito, o estudo de possíveis leveduras biocontroladoras, obtidas na Coleção Fungos de Solo – CFS, será de grande importância cientifica no controle do Diaporthe spp. deforma sustentável e eficaz.Item Efeito de nanopartículas de cobre e prata sobre as alterações fisiológicas e bioquímicas de plantas de arroz submetidas ao estresse hídrico, infecção de Bipolaris oryzae e feijão-caupi submetido ao estresse pela infecção do Fusarium oxysporum f. sp. tracheiphilum(2021) Lôbo, Rodrigo Albuquerque; Rios, Jonas Alberto; http://lattes.cnpq.br/1157022372359214; http://lattes.cnpq.br/9438329131277566Item Relatório do Estágio Supervisionado Obrigatório – ESO: laboratório de resistência de doenças de plantas/fisiologia do parasitismo(2019-12) Santos, Gleiciellen Silva Rocha dos; Rios, Jonas Alberto; http://lattes.cnpq.br/1157022372359214; http://lattes.cnpq.br/4034797851164504Item Relatório de Estágio Supervisionado Obrigatório(2020-11-08) Silva, Amanda Priscila da; Mendonça Júnior, Antônio Francisco de; http://lattes.cnpq.br/3551551589013115; http://lattes.cnpq.br/4645600895263723Item Identificação e caracterização de um novo putativo vírus da família Rhabdoviridae a partir de dados de sequenciamento de alto desempenho de mandioca (Manihot esculenta Crantz)(2022) Santos, Lucas Nascimento dos; Blawid, Rosana; http://lattes.cnpq.br/5904522485457534; http://lattes.cnpq.br/6206572147802969A mandioca (Manihot esculenta Crantz.) é uma das culturas agrícolas mais importantes no mundo. Apresenta rusticidade, adaptabilidade e múltiplas aptidões na alimentação humana e animal, in natura ou após processamento industrial. Dentre os fatores limitantes à cultura da mandioca estão as doenças, sendo possível encontrar uma série de patologias causadas por diferentes organismos, dentre os quais, os vírus estão entre os principais. Para que técnicas de manejo de doenças possam ser estudadas e implementadas no campo, é necessário que o agente causal da doença seja devidamente identificado, e, neste sentido, muitas ferramentas de bioinformática têm auxiliado os estudos taxonômicos e têm ajudado a compreender a diversidade biológica que há dentro de diferentes organismos. Deste modo, este trabalho objetivou realizar a identificação e caracterização in silico de sequências virais em dados de sequenciamento de alto desempenho (High-throughput sequencing, HTS) de mandioca disponíveis no NCBI. Os arquivos brutos de sequenciamento de mandioca foram obtidos do repositório SRA do NCBI. Os reads foram trimados no Trimmomatic v.0.36 e analisados quanto a qualidade com a ferramenta FastQC v.0.11.9. A montagem do genoma foi realizada através do SPAdes v.3.15 (k21, 33,55, 77, 99; --careful), e os contigs foram identificados através da ferramenta tBlastX. Os contigs foram estendidos através de mapeamentos consecutivos utilizando a ferramenta BBmap implementada dentro do software Geneious v.R11. O genoma completo foi caracterizado com base em motivos descritos na literatura (espaçadores intergênicos, motivos para início da transcrição e sinais de poliadenilação), além de regiões repetitivas. As ORFs foram identificadas através de análises realizadas com os bancos de dados do UniProt e Pfam. Além disso, foram identificados motivos conservados na proteína L (RdRp) através do alinhamento com sequências de outros gêneros dentro da subfamília Betarhabdovirinae. Também foram determinados possíveis sítios de glicosilação dentro da glicoproteína (G) utilizando a ferramenta NetNGlyc 1.0. O software SDTv1.2 foi utilizado para o alinhamento global de sequências do gene L (nt) de todos os representantes da subfamília Betarhabdovirinae. A pipeline utilizada neste trabalho foi eficiente para a montagem e caracterização da nova sequência viral encontrada nos dados de HTS de mandioca. O genoma viral montado apresenta um genoma estruturalmente característico à família Rhabdoviridae, porém, com a presença de uma ORF extra anterior ao gene L. Com base nos resultados obtidos, provavelmente, trata-se de uma nova espécie de um novo gênero dentro da família Rhabdoviridae. Estudos futuros deverão ser realizados para a confirmação da descoberta desta provável nova espécie viral.